如何制作系统发育树？

从比对好的序列或性状出发，用 IQ-TREE、RAxML、MEGA 或 BEAST 等软件推断树，保存为 Newick 文件，粘贴到上方的系统发育树生成器，选择画法并导出。只想快速展示分类关系时，一张分类谱系表就够了。

如何用表格制作系统发育树？

选"分类谱系表"，每行一个物种，从最高类群写到物种，例如"Mammalia, Primates, Hominidae, Homo sapiens"，共享类群的物种会共享分支。如果表格里是两两距离，选"距离矩阵"，用邻接法建树。

如何在 R 里制作系统发育树？

R 中的 ape、phangorn、ggtree 等包可以读取、构建和绘制树，ape::write.tree() 能把任何树对象存成 Newick。想不再写绘图代码就完成图，把 Newick 粘贴到这里，用可视化方式改标签和颜色即可。

如何用 DNA 序列制作系统发育树？

先用 MAFFT、Clustal Omega 或 MUSCLE 比对序列，再用 IQ-TREE、RAxML 或 MEGA 推断树并导出 Newick。本页负责画树，不做序列比对和建树计算。如果已经有两两距离，可用矩阵输入建邻接树。

如何在 Word 里制作系统发育树？

Word 没有树布局，可以在这里画好再插入：通过"插入 > 图片"插入 300 dpi 的 PNG 或 SVG。如果合作者需要在 Office 里改标签，下载 PPTX，每个标签都是可复制到 Word 的文本框。

如何在线制作系统发育树？

把 Newick 字符串、分类谱系表或距离矩阵粘贴到本页顶部的输入框，浏览器里立即出现预览。用免费账号登录后，可以在编辑器中打开并下载。

如何制作无根系统发育树？

邻接树和很多最大似然树都是无根树。这里以矩形样式绘制，把根放在最后一次合并处，显示为三分叉；暂不提供放射状或环形布局。要用外类群定根，请在建树软件中重新定根后再导出 Newick。

如何做出一棵好的系统发育树？

使用足够的信息位点、合适的替换模型和外类群，并报告分支支持率。作图时物种名用斜体，只在关键处显示支持率，为枝长加比例尺，字体与其他图保持一致。

能用 FASTA 文件制作系统发育树吗？

不能直接用。FASTA 文件存的是序列，需要先比对和建树。先用比对软件和建树软件处理，再把输出的 Newick 粘贴到这里。

有 AI 系统发育树生成器吗？

建树应该来自统计方法而不是语言模型，所以这个系统发育树生成器不会猜测亲缘关系，只会准确画出你提供的树。本站在其他地方用 AI 生成插画，例如放在树旁边的生物示意图。

系统发育树生成器免费吗？

免费。画树、编辑和保存都不消耗积分。保存和下载需要免费账号，免费版下载带角落小水印，购买任意套餐或积分包后去除。

可以粘贴 Newick 树吗？

可以。枝长、带引号的名称、表示空格的下划线、[注释]以及自展值等内部标签都能读取。最多支持 150 个末端；NEXUS 文件请复制"tree 名称 ="后面的 Newick 那一行。

可以导出哪些格式？

300 或 600 dpi 的 PNG、JPG，矢量 SVG，以及每个分支和标签都是可编辑 PowerPoint 对象的 PPTX。

系统发育树生成器

粘贴建树软件输出的 Newick、分类谱系表或距离矩阵，这个系统发育树生成器会画出符合发表风格的进化树：斜体物种名、支持率、枝长和比例尺。任意标签或分支都能编辑，导出后可直接用于论文、海报或幻灯片。

Newick 格式的树

按枝长末端对齐显示支持率

粘贴 IQ-TREE、RAxML、MEGA、FastTree 或 PhyML 输出的 Newick。下划线会显示为空格，最多 150 个末端。

免费：画树不消耗积分。编辑和下载需要一个免费账号。

什么是系统发育树生成器？

IQ-TREE、RAxML、MEGA、BEAST 等软件推断出树后以文本保存，自带的绘图很少能达到期刊要求。系统发育树生成器把这段文本变成图：排好分支，对齐或按比例放置末端，并给出可以设置样式的标签。它还能直接由分类表或两两距离矩阵建出简单的树。

在线系统发育树生成器，直接出图

不用安装软件，也不用开 R：打开页面，粘贴你的树，立刻就能看到。这个在线工具把每个物种名、支持率和分支都保留为独立的可编辑对象，导出的就是你设计好的图，而不是查看器的截图。

用表格或 Newick 生成系统发育树

支持三种输入。Newick：可带枝长、带引号的名称以及自展值或后验概率。分类谱系表：每行一个物种，从纲或目写到种，生成基于分类的分支图。距离矩阵：从表格软件粘贴两两距离，用邻接法建树。

系统发育图与分支图

可以按枝长比例画成系统发育图，并配上取整的比例尺；只关心分支顺序时，也可以把末端对齐画成分支图。树按多数期刊采用的矩形样式绘制，内部节点标签显示支持率或类群名。

为什么用我们的系统发育树生成器？

大多数树查看器是为浏览十万个末端设计的，而不是为下周要交的六联图。我们的系统发育树生成器专注最后一步：一棵清晰统一、与其他图风格一致、经过多轮审稿仍可编辑的树。

免费的论文用系统发育树生成器

画树和编辑都不消耗积分，每次修改都能免费使用。输出遵循常见期刊规范：斜体双名、节点处的支持率、带标注的比例尺，以及在矢量格式中始终清晰的线条。

编辑标签、颜色和类群

在编辑器里重命名末端、给某个类群换色、加粗分支、加括号和类群标签，或把树放在生物插画旁边。每次修改都保存为可以回退的版本。

搭配一张科研插画

支持率与比例尺

Newick 中的内部节点标签（如自展百分比或后验概率）会标在节点旁，比例尺按树的深度自动选取。想要更简洁的概览图，可以关闭支持率。

三步制作系统发育树

你只需要分析得到的树文件，或一张简单的表格。从粘贴到下载只要几分钟。

1
粘贴 Newick 或表格
选择 Newick、分类谱系表或距离矩阵，粘贴文本或载入示例。名称中的下划线会显示为空格，最多支持 150 个末端。
2
选择画法
选"按枝长"画系统发育图，或选"末端对齐"画分支图，并决定是否显示支持率。改动后预览立即重画。
3
编辑并导出
在编辑器里设置标签和类群样式，然后下载 300 或 600 dpi 的 PNG、JPG，SVG，或可编辑的 PPTX。